科属区别：大马哈鱼属于鲑形目鲑科太平洋鲑属大马哈鱼种。而三文鱼属于鲑形目鲑科鲑属。颜色区别：大马哈鱼背部为黄绿色，腹部为银白色，三文鱼的身体呈银灰色，肉呈粉红色。分布地区区别：大马哈鱼主要分布在太平洋北部以及北冰洋，而三文鱼除了太平洋北部外，在欧洲、亚洲和美洲的北部也有分布。

由于二者在类别上是不同的，所以在其它很多地方也是有差异的。比如大马哈鱼和三文鱼所包含的具体品种就是不同的。驼背大马哈鱼、孟苏大马哈鱼、银大马哈鱼等品种是属于大马哈鱼的挪威三文鱼、美国三文鱼等品种则是属于三文鱼的。另外，从外观来看，大马哈鱼和三文鱼也有一定的差异，大马哈鱼背部是黄绿色的，腹部是银白色的三文鱼的身体是银灰色的，肉是粉红色的。