三层过滤盒每层放什么滤材建议如下：针对三层过滤盒推荐由上到下，可以按照以下顺序来摆放滤材。

首先，最上层推荐摆放各类物理滤材。而物理滤材指的就是各种物理过滤棉以及生化棉，魔毯等东西。

其次，在中间层，我们可以摆放一些不规则的铝材，比如陶瓷环，玻璃杯除氨石，珊瑚骨等。

在最下层，我们可以摆放规则的细菌屋作为培养硝化细菌的主要阵地。