明朝首都有两个，一个是南京，一个北京。朱元璋建明朝的时候定都南京，后来永乐皇帝朱棣靖难之役后为了应对少数民族的威胁迁都到北京。号称“天子守国门，君王死社稷”。直到明朝终结皇帝都待在北京，但是南京除了没有皇帝以外也有一套官员体制。