元祖十三金刚（又称十三使徒）是元始天尊最初所创造的十三元祖，一直都是变形金刚中最模糊，最神秘的一部分。在2012年官方小说《普神圣约》中，终于把这13位金刚的身份交代清楚了。
在《变形金刚：领袖之证》中救护车的叙述中，元祖十三金刚是元始天尊为了打败宇宙大帝所创造的变形金刚，他们各自创造了自己的武器，并且合力打败了宇宙大帝，后不知去处，元始天尊也化为了赛博坦星球的核心。
在《变形金刚2》中天火的叙述中，元祖十三金刚是最早的变形金刚，他们离开星球寻找能源，来到了地球。但由于堕落金刚（震天尊）的反叛，其余的十二金刚将自身化为坟墓，保护了领导模块，防止被堕落金刚取得。
