通过RNA-Seq测序找出的差异基因一般有成千上万个，验证的时候一般只需要验证目标基因。具体选择哪些基因，取决于做RNA-Seq的初衷，或者说您要解决的生物学问题，然后结合GO富集和KEGG富集的结果入手，看看您关注的基因是否存在表达量的差异。

所以RNA-Seq测序得到的高通量的数据，不是所有的信息都可以用的上，最好可以结合生物学意义进行深入的研究。