オレは高校生探侦(こうこうせい たんてい)、工藤新一(くどう しんいち)。幼(おさな)なじみで同级生(どうきゅうせい)の毛利兰(もうり らん)と游园地(ゆうえんち)に游(あそ)びに行(い)って、黒(くろ)ずくめの男(おとこ)の怪(あや)しげな取(と)り引(ひ)き现场(げんば)を目撃(もくげき)した。取(と)り引(ひ)きを见(み)るのに梦中(むちゅう)になっていたオレは、背後(はいご)から近付(ちかづ)いて来(く)る、もう一人(ひとり)の仲间(なかま)に気付(きづ)かなかった。オレはその男(おとこ)に毒薬(どくやく)を饮(の)まされ、目(め)が覚(さ)めたら体(からだ)が缩(ちぢ)んでしまっていた!!工藤新一(くどう しんいち)が生(い)きていると奴(やつ)らにバレたら、また命(いのち)を狙(ねら)われ、まわりの人间(にんげん)にも危害(きがい)が及(およ)ぶ。阿笠博士(あかさ ひろし)の助言(じょげん)で正体(しょうたい)を隠(かく)すことにしたオレは、兰(らん)に名前(なまえ)を闻(き)かれて、とっさに江戸川(えどがわ)コナンと名(な)のり、奴(やつ)らの情报(じょうほう)をつかむために、父亲(ちちおや)が探侦(たんてい)をやっている兰(らん)の家(いえ)に転(ころ)がり込(こ)んだ。オレは毛利のおっちゃんを名探侦に仕立てるべく、时计型麻酔铳でおっちゃんを眠らせ、蝶ネクタイ型変声机を使って、おっちゃんの声でかわりに事件を解いている。この二つのメカは、阿笠博士の発明品だ!博士は他にも…ターボエンジン付きスケードボードや、犯人追迹メガネ、キック力増强シューズなど次々とユニークなメカを作り出してくれた!兰もおっちゃんも、オレの正体には気付いていない。知っているのは阿笠博士と、西の高校生探侦、服部平次、それに同级生の灰原哀…。彼女は黒ずくめの男の仲间だったが、组织から逃げ出す际、オレが饮まされたのと同じ薬を饮んで体が缩んでしまった!黒の组织の正体は、依然として谜のまま…! 「小(ちい)さくなっても头脳(ずのう)は同(おな)じ!迷宫(めいきゅう)なしの名探侦(めいたんてい)!真実(しんじつ)はいつもひとつ!!」