军师联盟司马懿纳妾的原因是妾乃是魏帝曹丕安排监视司马懿的探子。司马懿在曹丕登基过程中做出了巨大的贡献，曹丕登基以后，也重用司马懿，赋予了司马懿极大的权力，同时为防止司马懿有不轨动作，因此需要通过安排探子监视司马懿的一举一动，而纳妾是一种较为温和的监视方式。