战国时期的旗本队指的是大名所在的本阵中守护大名和军旗的队伍，也可以理解为大名的亲卫兵或近卫队。旗本队的武士被称为旗本武士，其地位比军队中一般的士兵高，战时非紧急需要情况不直接参与进攻作战。由于旗本队的职责非同寻常，其责任非常重大，所以队伍里的武士都是经过大名亲选或家臣从本家内值得信任的武士里精心挑选的优秀武士。