《大祠堂》以明末清初为历史背景，以徽商世家谢家为舞台，讲述了两朝三代徽商的一段悲情往事。剧中，谢氏家族是徽州的高门望族，不仅拥有悠久的历史，更有着森严的族规。族中子弟一旦违反族规，必将受到残酷的家族刑罚。

剧中，郑秀云被怀疑谋害丈夫谢致卿要接受家族审讯，面临沉江之刑罚谢致卿和离娘被认为有辱家族声誉，要遭受残酷的鞭刑，种种私刑令人发指。