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一般来说，珍珠玄凤鹦鹉多为母玄，最直接、最准确的区分方法是观察翅膀斑点：雌性玄凤鹦鹉的翅下有一排黄白色斑点，而雄性玄凤鹦鹉则没有这一特征，雄性玄凤鹦鹉在第一次换羽后会脱落羽斑，变成与原灰相同的颜色。雄鸟和雌鸟都有黄色的面部羽毛，不过雌性玄凤鹦鹉的嘴和眼睛周围有黄色的被毛，而雄性玄凤鹦鹉的大部分头部和顶冠前部都有黄色的羽毛。