设有58个临床医技科室，拥有3个国家临床重点专科建设项目（泌尿外科、肾脏内科、临床护理学），14个省级临床重点专科建设项目（儿内科、急诊科、产科、骨科、心血管内科、消化内科、内分泌科、妇科、普外科、神经外科、康复医学科、神经内科、眼科、胸外科），6个依托山东大学的省级重点学科（内科学、外科学、耳鼻喉科学、影像医学与核医学、口腔临床医学、护理学），5个省医药卫生重点学科（泌尿外科、肾脏内科、神经外科、神经内科、肾移植科），4个山东省医药卫生重点实验室（血液学、医学分子肝病学、肾脏病、血管生理与治疗），3个山东省“十二五”高校重点实验室（肾脏组织工程实验室、神经系统变性病转化医学实验室、消化系统肿瘤实验室），7个山东大学研究院、所、中心（山东大学泌尿外科研究所、山东大学血液肿瘤生物治疗研究所、山东大学组织工程研究所、山东大学神经病学研究所、山东大学肾脏病研究所、山东大学眼科中心、山东大学人体器官再造研究院） 。