芽孢根据外形,可分为圆形芽孢、椭圆形芽孢和多面形芽孢。其结构相当复杂,最里面为核芯,含原生质体,被芽孢膜所包裹。核芯外面为皮层,成分为肽聚糖,再往外是一层或数层蛋白质组成的芽孢壳,最表面为芽孢壁,也称芽孢外壁