a螺旋结构主要特点有：第一个肽平面联基（-C-）上的氧与第四个肽平面亚氨基（一NH一）上的氢形成氢键。氢键的方向与螺旋长轴基本平行）氢键是一种很弱的次级键，但由于主链上所有肽键都参与了氢键的形成，所以a螺旋很稳定。组成人体蛋白质的氨基酸都是L-α-氨基酸，形成右手螺旋，φ=-57°，ψ=-47°.侧链R基团伸向螺旋外侧。

根据多肽链主链旋转方向不同，a螺旋也可有左手螺旋，其φ=+57°，ψ=+47°，如噬热菌蛋白酶中就有左手a螺旋。