万历十三年没有书籍，万历十二年，利玛窦绘制第一张中文世界地图《山海舆地图》，介绍天下有五大洲：亚细亚、欧罗巴、利未亚、亚墨利加、墨瓦腊泥加.这是中国人首次接触到了近代地理学知识。

万历十二年，朱载出版《律吕精义》，书中提出了“新法密率”。这是中国音乐史上一件具有划时代意义的事件，也成为人类文化史上最早出现的十二平均律数学理论。