主要是因为阿塞拜疆和亚美尼亚矛盾重重，两国矛盾的关键点是纳卡问题，纳卡全称纳戈尔诺卡拉巴赫，位于阿塞拜疆主体国土内部。苏联时代，纳卡在行政区划上归属阿塞拜疆，苏联解体后，按照原有的区划，纳卡仍然属于阿塞拜疆，但因为纳卡地区以亚美尼亚人为主，因此常用脱离阿塞拜疆，并入亚美尼亚的打算。