京东山姆会员店有12元运费，可能是因为用户购买的商品金额没有满足店铺包邮门槛所以要收取运费，也可能是因为用户购买的商品超重因此要额外支付超重运费。

还有一种可能是用户收件地址是西藏等偏远地区因此下单时需要支付运费。