在真核微生物中，基因重组主要有有性杂交、准性杂交、原生质体融合和转化等形式。

（二）丝状真菌的准性生殖准性生殖是一种类似于有性生殖但比有性生殖更为原始的一种生殖方式，它可使同种生物两个不同菌株的体细胞发生融合，且不经过减数分裂的方式而导致低频率基因重组并产生重组子。这些基因特性对于进行基因重组具有重要的潜在价值。