有很多专业。东南大学建有四牌楼、九龙湖、丁家桥等校区。四牌楼为东南大学校本部，专业有建筑学专业、电气工程及其自动化专业、自动化专业、工程力学专业、城乡规划专业、生物工程专业、软件工程专业、材料科学与工程专业、测控技术与仪器专业、环境工程专业、劳动与社会保障专业、预防医学专业、信息工程专业、测绘工程专业、科学教育专业、计算机科学与技术专业、英语专业、电子科学与技术专业、生物医学工程专业、法学专业等专业。

该校区为研究生教育、本科生高年级教育、继续教育(除医学学科外)和科学技术研究基地。