赣南医学院有三个附属医院，分别是赣南医学院第一附属医院，赣南医学院第二附属医院，赣南医学院第三附属医院。其中一附院，三附院在赣州市区，二附院在信丰县。做大做强实力最强的是第一附属医院，有章贡区院区和黄金开发区院区，综合实力赣州第一。