芽孢多形成于细菌对数⽣长期末期， 与营养的消耗、代谢产物的积累等环境因素有关， 但能否形成芽孢是由细菌基因组决定的。芽孢具有菌体的酶和核质等成分，故能保持细菌⽣命活动的延续。

细菌芽孢形成时， 细菌染⾊体⾸先发⽣构型变化，两条染⾊体凝集成束状， 通过中介体与细胞膜相连 细胞质膜借中介体内陷、延伸，形成双层膜， 构成芽孢的横隔壁， 将核质与⼀部分细胞质包围， 形成细胞不对称分裂， 从⽽形成⼩体积部分的前芽孢 。