公司的三方协议不可以都拿回来的。所谓三方协议是指用人单位、应届毕业生和学校共同签订的就业协议，因此三方协议需要各方保留一份，而单位的需要存入单位档案材料中，个人的则自己保存，学校的需要换取报到证后交个应届毕业生就职。