新型农村合作医疗在手机上缴费有几种渠道，可以在微信城市服务上交，可以在广西税务12366公众号上交，也可以在支付宝市民中心上交，在税务公众号上交的话先点开该公众号，点击医保缴费，输入身份证号码姓名，医保年限以及确定经办机构，确认后微信支付即可，其他平台操作差不多的。