被公司辞退了，档案案一般不会有污点。现在绝大多数的企业都没有档案的保管权了，为员工建立的档案都属于用工档案，它并不与劳动者本人实际的档案相关联，出现了违反公司规章制度的情形，企业辞退员工。只要员工按照规定办理了解除劳动关系手续，就不会对自己的档案有影响。