区别主要体现在以下3个方面：
1、有编制的教师可以调动，有相应的职称工资并可以晋升，退休后享受相应的社保和职业年金。无编制的教师往往属于临聘人员，无法晋升，无法调动，往往也无职称，更无职称工资。退休后按照与当初所在单位签订的合同处理。
2、教师的编制属于全额拨款事业单位编制，享受事业单位工作待遇。人事代理教师，一般跟劳务派遣公司签订合同，由劳务派遣公司支付工资，待遇较差，而且缴纳的社保比较少或者只缴交部分，如工伤保险。
3、有编制的教师属于国家编制人员，工作更有保障，更稳定。人事代理教师属于企业员工，不纳入国家编制，工作不稳定。
