个人住房公积金每次只能提取一部分的原因是：

一是，个人用公积金支付租赁房屋房租支出时，按照公积金管理办法的相关规定，提取公积金额度不能超过房租支出部分

二是，个人使用商业贷款购买房屋时，每年可以提取公积金用于还贷的，但提取的数额不能超过每月贷款数额的

三是，个人用于其他用途的提取，都是有使用金额限制的。