刑事诉讼中的专门机关主要有人民法院、人民检察院和公安机关。另外，还包括国家安全机关、军队保卫部门、监狱、海关走私犯罪侦查部门等。

1、公安机关：公安机关是国家行政机关，是各级人民政府的组成部分专门负责治安保卫工作。

2、检察机关：人民检察院是我国的法律监督机关。

3、审判机关：人民法院是代表国家行使审判权的司法机关。