中枢制度又随着朝代的变更发生了改变。主要是开始了有三公九卿制开始转行为了三省六部制。比如说“把三公列入了八公并置”， 到魏晋南北朝时期，政体又有变化。

大体上讲，尚书台（尚书省）的性质发生变化，它从少府中独立出来，但却由国家政务中枢变为国务总署，即由中央决策机构变成中央最高行政执行机构，主管行政执行事务。尚书诸曹取代九卿，直接处理具体行政事务。中书省、门下省成为新的中枢决策机构。这是三省制产生的时期，也是“群相制”产生时期。