城市轨道交通主要部门除了常规公司的都有的总经理办公室，人力资源，安保部，财务等部门。

还有其特别的职能部门，包括一，控制中心，负责线路的调度指挥。

二，乘务部门，负责列车的驾驶及列车故障处理。

三，客运部门，负责引导乘客乘车和乘客其他需求服务。

四，通信信号部门，负责线路上的通信设备，信号设备维护。

五，工务部门，负责线路上的钢轨等设备维护。

六，供电机电部门，负责线路上的供电及自动化设备维护。

七，车辆部门，负责电客车及工程车的维护。当然各家地铁公司可能分类不同，存在差异，大体如上。