不算。南通市水路运输一般算内河航运，这上边的船员是不算特殊工种的，如果是技术人员，才能算是特殊工种。如果是在出海的远洋轮上，那么不论是一般船员，还是技术人员都可算特殊工种。退休时在年龄上有所照顾，具体政策各地有差异，可咨询当地的劳动部门。