栖霞区下辖9个街道，68个社区、49个村，其中龙潭、栖霞、西岗3个街道整建制委托南京经济技术开发区管理。具体街道有:尧化门、仙林、迈皋桥、八卦洲、马群、龙潭、栖霞、西岗、燕子矶。栖霞区位于南京市主城北部，面积395.44平方千米（含长江水面），北起栖霞区龙潭街道马渡村东长江中心航道，与镇江市丹徒区、句容市接界自马渡村沿便民河至龙潭街道，经东阳至漳桥一线，与句容市接界再绕西岗果牧场南端，以灵山与南京市江宁区接界。