有权决定特别行政区制度的国家机关是全国人民代表大会。

特别行政区指在中华人民共和国行政区域内，根据宪法和法律的规定而设立的具有特殊法律地位，实行特殊的社会制度、政治制度、经济制度和文化制度等的行政区域。特别行政区仍然是中华人民共和国领土不可分离的部分，是在中华人民共和国中央人民政府统一领导下的地方行政区域，但享有高度的自治权。