哈尔滨新区和哈尔滨市区有联系也有区别。首先，哈尔滨市区包括哈尔滨新区，新区是市区的有机组成部分。

其次，新区是经国家批准设立的，具有特别功能的行政区划地域。哈尔滨新区是经过国务院发文特批的国家级经济改革开放试验区之一。