研究所拥有省部级等各类科研平台12个，其中包括部级平台2个、省级工程技术研究中心2个、省级重点实验室2个、国际联合实验室1个、市级重点实验室1个、院级研究中心3个和所企合作研究中心1个。

最好的是部级平台(2个):农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室、农业部转基因植物及植物用微生物环境安全监督检验测试中心(海口)。