生物工程专业是目前郑州大学科研成果转化能力最强的专业。本专业面向我省生物医药与人口健康等领域的重大科技问题，在生物化学与生物工程制药、免疫与抗体工程等方向位于全国前列。

该专业本科毕业生50%以上保送或考取研究生，约1%出国深造，其余毕业生主要可到医药、轻工、食品、环境工程、能源、生物安全等部门从事科研、技术开发、新产品开发、工艺及设备等工程技术，或从事生产、管理、经营，还可以所学知识为支持，从事教育、商贸、政府管理部门等其他行业工作。