是的，一个是初中部，一个是高中部。为创建广东省国家级示范性普通高级中学，2004年，佛山市禅城区政府决定佛山市第三中学初、高中分离，政府投资2.8亿元，选址东平二路33号，建设现代化新校区。2005年7月29日，佛山市第三中学迁入新校区，实现初、高中分离。佛山市第三中学初中部在原校址。