北京工商大学是2018年成为博士学位授予单位的，目前有一级学科博士学位授权点有2个，分别是应用经济学、食品科学与工程！北京工商大学还有1个联合培养博士学位授权点，与中央财经大学联合招收和培养会计学专业博士研究生。学校现有博士后20人（含联合培养8人），博士生84名。