纪年方法不精确。修昔底德在叙述历史事件时，只使用“冬季”和“夏季”来纪时，不写具体日期。这样就不能给人以明确的时间概念，容易混淆史实。

当然，修昔底德仍不失为古希腊杰出的历史学家，他的《伯罗奔尼撒战争史》仍然是西方史学史上的重要里程碑。有人曾评论道：“尽管修昔底德比希罗多德只晚生了25年，但他们两人对历史的理解却大不相同从希罗多德到修昔底德，史学几乎要进步一个世纪。”这是对修昔底德史学成就的高度评价。