正厅级。

学校是国家高等教育综合改革试验校，是由广东省领导和管理的全日制公办普通高等学校，是深圳市创办的一所创新型大学。

2011年3月，南科大教改实验班开学，2012年4月，教育部同意建立南方科技大学，并赋予学校探索具有中国特色的现代大学制度、探索创新人才培养模式的目标。2018年5月，南方科技大学获批博士学位授予单位，成为国内最快获得博士授权单位的高校。