西南交通大学医学院是在2014年7月8日由西南交通大学与成都市第三人民医院及7月10日由西南交通大学—成都军区总医院三方共同签署战略合作协议共建的,西南交通大学医学院、西南交通大学基础医学院、西南交通大学临床医学院、西南交通大学附属医院揭牌成立。