上海最高排名的大学前三名：复旦大学、交通大学、同济大学。

这三所学校都是985和211工程大学。

复旦大学是教育部直属的全国重点大学，中央直管副部级建制。位列国家首批“双一流”、“985工程”、“211工程”重点建设高校。

上海交通大学是教育部直属并与上海市共建、中央直管全国重点大学，位列“世界一流大学建设高校”、“985工程”、“211工程”。

同济大学是教育部直属并与上海市共建的全国重点大学国家“世界一流大学建设高校”，国家“211工程”和“985工程”建设高校。