不是，是归国务院管。中华人民共和国科学技术部是国务院组成机构，中科院是国务院直属事业单位，不存在谁管谁。中华人民共和国科学技术部是国务院组成机构，其主要工作是研究提出科技发展的宏观战略和科技促进经济社会发展的方针、政策、法规研究科技促进经济社会发展的重大问题研究确定科技发展的重大布局和优先领域推动国家科技创新体系建设，提高国家科技创新能力。

研究提出科技体制改革的方针、政策和措施推动建立适应社会主义市场经济和科技自身发展规律的科技创新体制和科技创新机制指导部门、地方科技体制改革。