1、以“赣南医学院”的英文缩写“GMU”为设计元素，变形为一组奋飞的鹏鸟，象征赣医人团结奋进、无私奉献、开拓创新的精神风貌与时代气质。喻意赣南医学院各项事业协调持续发展的良好态势和远大的发展前景。
2、图形整体似双手捧起红“十”字的情形，突出医学教育，象征着赣南医学院坚持“教学立校、科研兴校、人才强校”的办学方针，以人为本，注重教学与科研有机结合，教学相长。同时，喻意赣医人以毕生的时间和精力，投注于人类神圣的医学教育和医疗卫生事业的美好形象。
3、图案主体下方“1941”为建校时间，寓意赣南医学院多年办学历史积淀所形成的发展平台。
4、外圈中文校名“赣南医学院”用毛体字，显得庄重大气，与英文校名“GannanMedicalUniversity”和谐形成一圆形，象征赣医人团结一致，开放式办学，不断取得新成绩，获得新突破。
