连云港既没有长江也没有黄河。连云港水系基本属于淮河流域沂沭泗水系,沂沭地区的主要排洪河道新沂河,新沭河等均从市内入海,故有洪水走廊之称。

连云港境内还有玉带河,龙尾河,兴庄河,青口河,锈针河,柴米河,蔷薇河,善后河,盐河等大小干支河通40余条,有17条为直接入海河流,有盐河等河直接与运河及长江相通。