1、真核生物有多个复制起始位点，而原核只有一个起始位点。

2、真核生物复制一旦启动，在完成本次复制前，不能在再启动新的复制，而原核复制起始位点可以连续开始新的复制，特别是快速繁殖的细胞。

3、真核生物和原核生物的复制调控不同。

4、原核的DNA聚合酶III复制时形成二聚体复合物，而真核的聚合酶保持分离状态。

5、真核生物的聚合酶没有5'-3'外切酶活性，需要一种叫FEN1的蛋白切除5'端引物，原核的DNA聚合酶I具有5'-3'外切酶活性。