东莞中学南区是生活区。

东莞中学的北区和南区，全部为高中所用其中，北区为教学区域，南区为体育活动及生活住宿区域。而东莞中学的南区和北区之间，隔着一条东正路，平时车流不少学生们主要通过这座天桥，来往于教学区和生活区。

除了重建教学楼外，为了保证施工期间正常教学所需，东莞中学将在南区足球场上新建临时板房教室 24 间，其中普通课室 20 间、走班课室 2 个，级组办公室2间。此外，东莞中学还将配建地下二层连接南区的地下通道，净宽 8 米，同时升级改造教学楼前广场升级改造。