中国科学院地球化学研究所建设有4个基本研究单元,包括有2个国家重点实验室。

该所基本研究单元:矿床地球化学国家重点实验室、环境地球化学国家重点实验室、中国科学院地球内部物质高温高压实验室、月球与行星科学研究中心

国家重点实验室:矿床地球化学国家重点实验室、环境地球化学国家重点实验室