经南宁市教育局批准，南宁三中两个校区采取独立招生。2017年青山校区计划招收18个班972人，其中指令性计划875人，指导性计划97人。2017年五象校区计划招收22个班1188人，其中指令性计划1069人，指导性计划119人。

南宁三中在收费方面按照南宁市收费标准收费，每学期学费590元、住宿费400元。