首先，如果土地性质是工业用地。那么建在工业用地之上的建筑，严格说是不能作为商业用途的，其最多只能做企业内部商业用途。也就是说，如果涉及拆迁补偿，只会按照工业用地标准之上的工业用建筑标准进行赔偿。并不会以商业用地之上的商业建筑标准进行赔偿。

另外严格的说，如果真被征用，政府将该建筑物定义为违章建筑，也不算错。还可以要求你限期自行拆除。