1，利用的能量不同，前者以二氧化碳为主要碳源，以无机含氮化合物为氮源，合成细胞物质，并通过氧化外界无机物获得生长所需要的能量.后者以阳光、水、二氧化碳在叶绿体上合成有机物.

2，进行这两种反应的生命载体不同，前者某些是低级的微生物后者主要是高级的绿色植物，极少数低级微生物和细菌也可以.

3，两种反应需要的原料条件和产物不同，前者以二氧化碳为主要碳源，以无机含氮化合物为氮源，合成细胞物质，后者是利用光合色素，将二氧化碳（或硫化氢）和水转化为有机物，并释放出氧气（或氢气）的生化过程.