为了进一步促进南京航空航天大学博士生的培养工作，提高博士学位的授予质量，南京航空航天大学研究生院先后出台了优秀博士、硕士学位论文评选及奖励办法，培育优秀博士学位论文试行办法以及关于博士学位论文隐名评审实施办法等，设立了博士学位论文创新与创优基金，制订了研究生“双语教学”课程建设计划实施意见，推动了我校研究生尤其是博士生培养质量的全面提高，学校已获全国优秀博士学位论文3篇，省优秀博士学位论文10篇，省优秀硕士学位论文25篇。